در حال حاضر مراکز دانشگاهی ذیل اقدام به انتقال حساب حقوق و مزایا به بانک مهر ایران نموده اند:

• دانشگاه خوارزمی
• دانشگاه فرهنگیان
• دانشگاه تهران 
• دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی